Msida St Joseph Football Club (msidiensisk: Klabb tal-Futbol Msida San Ġużepp) är en maltesisk fotbollsklubb baserad i staden Msida. Klubben grundades 1906 och spelar för närvarande i Maltese First Division.

Msida St Joseph har vunnit den maltesiska cupen en gång, 1979-80. Klubben har också spelat i UEFA Intertoto Cup vid två tillfällen, 1998 och 2001.

Msida St Josephs hemmaarena är Ta' Qali National Stadium, som de delar med flera andra maltesiska klubbar.