Atlético Melilla är en spansk fotbollsklubb baserad i Melilla, en autonom stad i Nordafrika. Klubben grundades 1946 och spelar för närvarande i Segunda División B – Grupp 4.

Atléticos hemmaarena är Estadio Municipal Álvarez Claro med en kapacitet på 12 000. Klubbens färger är blått och vitt.

Atléticos mest framgångsrika period var på 1950- och 1960-talen, då de spelade flera säsonger i Segunda División. Klubben har också tävlat i Copa del Rey vid flera tillfällen och nådde 16-delsfinal 1956–57.

Bland anmärkningsvärda spelare som har representerat Atlético Melilla finns Manuel "Manolo" Jiménez, som senare blev tränare för Sevilla FC och Real Betis, samt Ismael López, som spelade för Barcelona och Real Betis.